自1990年起至今，IPCC已經組織編寫出版了一系列評估報告、特別報告、技術報告和指南等，對科學界和全球政治產生了重大影響。IPCC評估報告匯集了全球有關氣候變化的最新研究成果，已經成為氣候變化領域的標準參考著作，被決策者和科學家廣泛使用，對氣候變化決策和國際談判產生了重要影響，尤其為聯合國氣候變化框架公約的制定與實施提供了重要科學依據。
秦大河自1998至今連續三屆參加和領導IPCC科學評估工作，對加深全球氣候變化科學認識發揮了重要作用。
秦大河總結了IPCC最新評估工作對全球氣候變化的四點基本科學認識：一是過去一百年來，全球氣候系統呈現出以變暖為主要特征的顯著變化，預估未來100年全球氣候還將繼續變暖；二是全球氣候變暖的機理上，認為人類活動（特別是溫室氣體排放）很可能是工業化以來全球氣候系統變暖的主要原因；三是在這個背景下，極端氣象災害增多增強、冰川退縮、凍土退化、海平面上升、水資源匱乏、土地沙漠化、生物多樣性受損，威脅著人類生產、生活乃至生存，并對自然生態系統和經濟社會系統帶來嚴重影響；四是應對全球氣候系統變暖，需要世界各國的共同努力，需要全社會在控制溫室氣體排放、節約能源資源、加強防災減災能力建設等多方面采取更加有效的措施。
IPCC因對氣候變化科學的貢獻及其全球影響力，被授予 2008年度諾貝爾和平獎，秦大河受中國政府派遣，出席了頒獎儀式。
（六）推動資源環境領域改革，優化科技創新體制
秦大河任中科院資源環境科學與技術局局長期間，銳意創新，大膽改革，調整和發展了資源環境科學領域學科布局，對建立健全國家創新體系做出了積極貢獻。他調整工作重點，提拔青年干部，制訂適應新形勢的工作方法和作風，提高管理工作水平，在中科院的領導下，中國科學院資環領域工作有了新發展。主要包括：構建了資源環境領域知識創新的基地框架；實施了研究所的結構性調整，增強了研究所的綜合實力；組織實施了院西部行動計劃，進行西部地區環境演變規律與資源可持續發展的研究，啟動了5個典型生態脆弱地區（內蒙古草原、黃土高原、黑河流域、塔河下游、岷江上游）生態恢復的試驗示范研究、云南天然藥物的研究；開展了相關領域的規劃，如規范中國生態系統研究網絡（CERN）的管理，籌劃區域大氣本底觀測網絡、特殊環境與災害監測研究網絡、地磁臺鏈的建設，并積極推動國家野外科學觀測研究臺站建設。啟動了中國碳循環項目，加強了我國南極地區的科學研究、醞釀了青藏高原研究所的成立，等等。
（七）提出新時期氣象事業發展的戰略方向和科學理念秦大河主持的《中國氣象事業發展戰略研究》，對認識如何發展新形勢下的中國氣象事業做出了重要的理論貢獻。其中對于氣象事業改革和發展具有重大指導意義的有兩條，一是在戰略定位中明確氣象事業是科技型、基礎性社會公益事業，二是在戰略思想中明確堅持公共氣象的發展方向，樹立“公共氣象、安全氣象、資源氣象”理念，經國務院確認，成為新時期指導我國氣象事業發展的總體方向。對照“三氣象”的發展理念，秦大河認為氣象部門還有許多不足，制約氣象事業發展。具體表現在四個方面：一是站網布局不符合氣候系統觀測的要求，綜合觀測不能滿足提高氣象預報預測準確率及其他新拓展業務的需求，新的業務服務發展不快，缺乏基礎業務支撐，特別是探測的支撐；二是預報、預測、預估體制不符合公共、安全和資源氣象的發展要求，導致了天氣預報時效和精細程度不高，也使得經濟社會發展亟需的氣候變化、大氣成分、生態與農業氣象、雷電、空間天氣、人工影響天氣等業務發展緩慢；三是由于科研和人才機制缺乏活力，使得氣象科技含量高的成果不多，且科研成果向業務服務的轉化能力不強，高素質人才嚴重不足，隊伍的知識結構、專業結構和資源配置不合理，在人才的培養、使用和引進上存在著誤區。四是部門分割的管理體制客觀上形成了重復建設、數據和資源不能共享的局面，不同程度地影響了信息、科技和人才的必要流動。
秦大河提出實施科技興氣象戰略，認為實施這項戰略必須具備深遠的戰略眼光。應該看到學科不斷交叉融合、新的科學前沿不斷出現、技術創新不斷取得突破、科技經濟一體化深入發展的趨勢和特點；看到適應、減緩和應對未來全球氣候變化，促進人與自然和諧，是人類社會發展不可回避的重大問題；看到氣候系統五大圈層之間的物理、化學、生物過程與人類活動影響相互交織、多重疊加的復雜性；看到地球觀測繼續向多圈層的全程、實時和定量監測的方向發展，天氣預測預報繼續向無縫隙的方向發展，氣候預測和預估模式繼續向更廣領域、更加集成的地球系統模式方向發展，氣象服務繼續向多元化、全球化方向發展。因此，他強調應瞄準對提高氣象科學水平和業務應用有全局性影響的關鍵科學技術問題，進行重點研究，實現重要突破，獲得有世界影響的科技成果，為氣象事業的全面發展提供強有力的科技支撐。為此，他啟動了配套的氣象業務技術體制改革，確立了“多軌道、集約化、研究型、開放式”改革方針，為新時期氣象事業發展做出了歷史性貢獻。
他積極推動氣象部門與相關高校合作，形成人才培養和使用上良性互動的生動局面；與兄弟部委聯合，使氣象科研與業務走向更廣闊的服務天地，反過來以需求促業務，推動氣象科技與業務的發展。在多圈層、多部門合作理念下，秦大河領導全國多部委聯合，共同設計了中國氣候觀測系統(CCOS) ，既與全球氣候觀測系統（GCOS）接軌，又結合中國實際，大大推動了我國地球觀測系統的建立。
（八）人才培養
全國各高校和部委，并吸引了越來越多的國際學員，受到歡迎。并在中國科學院研究生院主講《冰凍圈科學概論》課程。秦大河非常注重中外聯合培養研究生，注重學科發展上緊跟國際前沿。平時給任務、壓擔子，在實際工作中鍛煉和培養青年人才。他培養的研究生，一部分已經成長為相關研究領域的重要骨干。
秦大河具有獨到的人才觀，尤其強調“復合型”人才不可或缺。他認為，當今中國發展快，要全面落實科學發展觀，涉及到經濟社會可持續發展，特別涉及到人與自然和諧發展，要調解復雜的人地關系。資源環境領域的科學研究和人才培養，要為資源環境領域的科學研究和社會發展提供理論和人才支持。
在秦大河的努力下，中國專家在IPCC報告中擔任主要作者的專家人數大幅提高，從第一次評估報告的9人上升到第四次評估報告的28人。迄今我國共有100多位科學家參加了IPCC評估報告和特別報告的編寫和評審，這些科學家來自全國多個部委和高校，越來越多的年輕科學家開始走上國際科學舞臺，極大地強化了我國在IPCC相關活動以及國際氣候變化研究領域中的影響和作用，為我國在環境外交中爭取主動和推動社會經濟的可持續發展發揮了積極作用。
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